En el transcurso de unos ejercicios de entrenamiento, dos oficiales de la marina encuentran el submarino "Nautilus" hundido en el fondo del mar. Dentro del submarino, el capitán Nemo se mantiene en estado de "suspensión criogénica".,Tras ser reanimado, los oficiales le persuaden para que ponga su sumbarino, dotado con la tecnología más avanzada, al sercicio de una agencia anticriminal del gobierno cuya misión más inmediata es detener al malvado profesor Waldo Cunningham, que mantiene amenazado Washington desde su base de submarinos nucleares. El perverso plan del profesor consiste en destruir la ciudad si no recibe en un corto plazo de tiempo un millón de dólares.,Sin embargo, antes de emprender el regreso, el capitán Nemo no puede evitar pasar primero por la Atlántida.