No son ni plantas ni animales. Son distintos a otras formas de vida como los microorganismos y hongos. Se les conoce como Mushi. Su existencia y apariencia son desconocidas para la mayoría excepto para un numero limitado de humanos.Ginko es un Mushishi que viaja para investigar y conocer más a estos seres. En el camino, ayudará a gente que tiene problemas con ciertos sucesos paranormales relacionados con los Mushi.... En la práctica, una suerte de espíritus parasitarios que flotan por todas partes sin ser vistos y que afectan a los humanos de muy diversas maneras, los mushi' son definidos al comienzo del film como El fantasmal espíritu de la naturaleza que respira dentro de todo ser vivo... y muerto". Ginko (Jô Odagiri), que puede verlos, se ha convertido en mushishi', un experto en tales criaturas que ejerce como sanador.