Un grupo de investigadores desaparece en las montañas de Turquía, donde, según la Biblia, cayó el Arca de Noé. Se llaman Spriggan y pertenecen a una organización que busca los enigmas de antiguas civilizaciones. A la vez, desaparecen tres satélites militares estadounidenses. Meses más tarde, en Japón, un Spriggan recibe un mensaje-bomba anónimo. Va a empezar una guerra que determinará la supervivencia de la humanidad.... Un grupo de científicos investigan en Turquía algo relacionado con antiguas civilizaciones, dicho grupo es llamado "Spriggan". Pero pronto se pierden contacto con ellos y otro Spriggan de Japón, Yu Onimae, contraviniendo las órdenes va en su ayuda. Nada más llegar es atacado y alguien de la antigua base científica le ayuda... acaba de empezar una lucha que podría destruir a la humanidad.