Japón comienza a sufrir una alarmante contaminación de la que no existen precedentes. De repente, del mar surge Hedorah, una extraña criatura que se alimenta de la polución, lo que provoca que crezca de forma desproporcionada. Se trata de una especie de burbuja tóxica viviente, dotada para volar y con la sangre veneno. Sólo Godzilla puede detener a un monstruo que pone en peligro a Japón.